В случае манифестации неонатальным холестазом риск формирования цирроза с быстрой декомпенсацией в течение 4-6 лет достигает 60%. При хроническом течении вероятность развития хронического гепатита и цирроза у взрослых с фенотипом PiZZ увеличивается с возрастом и составляет 2% в возрасте 20–40 лет, 5% – в возрасте 40–50 лет и 15% – в возрасте старше 50 лет. Частота развития гепатоцеллюлярной карциномы на фоне цирроза – 2–3% в год.